北京大學(xué)黃曉軍、李程、常英軍合作揭示G-CSF通過重塑T細(xì)胞三維基因組結(jié)構(gòu)誘導(dǎo)免疫耐受分子機(jī)制
異基因造血干細(xì)胞移植(allo-HSCT)是目前治療血液系統(tǒng)惡性腫瘤的有效手段。但移植后合并癥移植物抗宿主疾?。℅raft-versus-host disease,GVHD)是造成移植后患者死亡的主要原因之一,嚴(yán)重影響了患者的生存及生活質(zhì)量。GVHD可分為急性GVHD(aGVHD)和慢性GVHD(cGVHD),aGVHD在造血干細(xì)胞移植患者中的發(fā)生率為25%—55%,而cGVHD在患者中的發(fā)生率約為40%。無論是aGVHD還是cGVHD患者,對(duì)于一線激素治療無效的患者,目前均缺乏有效的二線治療藥物。而激素治療無效的aGVHD患者長(zhǎng)期生存率較低,僅為5%—30%。因此,尋找aGVHD有效預(yù)防及干預(yù)靶點(diǎn)是亟待解決的科學(xué)和臨床問題。
G-CSF(Granulocyte colony-stimulating factor)是粒細(xì)胞刺激因子,可以刺激骨髓中髓系祖細(xì)胞增殖并向成熟粒細(xì)胞分化發(fā)育。對(duì)健康供者給予G-CSF預(yù)處理,不僅可以將骨髓中CD34+造血干細(xì)胞動(dòng)員至外周血,同時(shí)G-CSF還可以通過調(diào)控T細(xì)胞以及APCs(抗原提呈細(xì)胞)的活性和功能而進(jìn)一步調(diào)控免疫系統(tǒng)。在臨床研究及小鼠GVHD模型中均表明,G-CSF可通過抑制T細(xì)胞活化,誘導(dǎo)產(chǎn)生T細(xì)胞免疫耐受從而降低aGVHD的發(fā)生。然而,G-CSF誘導(dǎo)T細(xì)胞免疫耐受的分子機(jī)制尚未有明確研究。
2022年5月18日,北京大學(xué)血液病研究所所長(zhǎng)、國家血液系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心主任黃曉軍教授,北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院李程研究員,北京大學(xué)血液病研究所常英軍教授合作,在Advanced Science期刊發(fā)表了“Multiomics Analysis Identifies SOCS1 as Restraining T Cell Activation and Preventing Graft-Versus-Host Disease”的研究論文。在本項(xiàng)研究中,研究人員利用多組學(xué)測(cè)序手段RNA-seq、ATAC-seq、Hi-C等技術(shù),分析了G-CSF動(dòng)員前、后健康供者骨髓來源的CD3+CD4+和CD3+CD8+ T細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組、染色質(zhì)開放性及三維基因組結(jié)構(gòu)變化(圖1A)。多組學(xué)分析提示,G-CSF動(dòng)員后的T細(xì)胞中正向調(diào)控T細(xì)胞相關(guān)活化基因的表達(dá)水平下調(diào),負(fù)向調(diào)控T細(xì)胞增殖及活化相關(guān)信號(hào)通路表達(dá)上調(diào)(圖1B)。ATAC-seq分析也表明,T細(xì)胞活化相關(guān)基因所在染色質(zhì)區(qū)域在G-CSF動(dòng)員后的T細(xì)胞中染色質(zhì)開放性下降(圖1C)。
圖1. G-CSF動(dòng)員前后T細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組及染色質(zhì)可及性變化
通過整合RNA-seq,ATAC-seq及Hi-C的多組學(xué)數(shù)據(jù)分析,研究人員發(fā)現(xiàn)SOCS1是G-CSF動(dòng)員后表達(dá)水平上調(diào)最為顯著的基因,而轉(zhuǎn)錄因子STAT3可能是直接調(diào)控SOCS1表達(dá)的上游因子(圖2A)。進(jìn)一步整合分析原代T細(xì)胞中增強(qiáng)子信號(hào)(H3K27ac)以及STAT3的染色質(zhì)結(jié)合(CUT&Tag)數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn),G-CSF可能通過重構(gòu)SOCS1基因編碼區(qū)的染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)上調(diào)SOCS1表達(dá)水平。在G-CSF動(dòng)員后的T細(xì)胞中SOCS1的基因編碼區(qū)附近,STAT3的結(jié)合重構(gòu)染色質(zhì)環(huán),促使SOCS1啟動(dòng)子區(qū)域與上游的增強(qiáng)子區(qū)域互作加強(qiáng),而由CTCF介導(dǎo)的SOCS1啟動(dòng)子區(qū)域與下游的異染色質(zhì)區(qū)域互作水平降低,從而上調(diào)了SOSC1的表達(dá)水平(圖2B)。
圖2. G-CSF通過STAT3介導(dǎo)的染色質(zhì)環(huán)重構(gòu)上調(diào)T細(xì)胞SOCS1表達(dá)水平
進(jìn)一步,為了驗(yàn)證SOCS1在T細(xì)胞活化中的調(diào)控作用,研究人員首先利用慢病毒在體外人原代T細(xì)胞中過表達(dá)了SOCS1基因,發(fā)現(xiàn)T細(xì)胞增殖能力顯著降低,同時(shí)T細(xì)胞耗竭相關(guān)分子TIGIT表達(dá)顯著上調(diào)。接著構(gòu)建了T細(xì)胞特異性敲除Socs1的轉(zhuǎn)基因小鼠,從體內(nèi)水平探索SOCS1對(duì)T細(xì)胞的調(diào)控作用。T細(xì)胞缺失Socs1后增殖能力顯著增強(qiáng),促炎因子IFN-γ分泌水平顯著增多。此外,在由供鼠C57BL/6移植受鼠BALB/c建立的GVHD小鼠模型中,接受Socs1-/-T細(xì)胞移植的GVHD受鼠相較于接受野生型T細(xì)胞移植的受鼠生存期顯著縮短,同時(shí)在肝、肺、小腸及大腸等組織有更明顯的淋巴細(xì)胞侵潤(rùn)導(dǎo)致的組織損傷。研究人員進(jìn)一步利用G-CSF或PBS預(yù)處理的供鼠移植受鼠建立GVHD模型,探索T細(xì)胞缺失Socs1后是否影響G-CSF對(duì)GVHD受鼠的保護(hù)作用。在野生型組,供鼠經(jīng)過G-CSF處理后相較于PBS處理組顯著延長(zhǎng)了GVHD小鼠的生存期。而在Socs1-/-組,供鼠經(jīng)過G-CSF處理后的GVHD受鼠生存期與PBS處理組無顯著差異。以上結(jié)果提示,T細(xì)胞缺失Socs1后G-CSF對(duì)GVHD小鼠的保護(hù)作用消失,證明G-CSF在體內(nèi)通過上調(diào)T細(xì)胞中SOCS1水平從而誘導(dǎo)T細(xì)胞進(jìn)入免疫耐受態(tài),從而降低GVHD損傷。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),SOCS1不僅對(duì)CSF3R/JAK2/STAT3信號(hào)通路有抑制作用,同時(shí)對(duì)NLRP3炎癥小體信號(hào)通路也具有抑制作用。利用SOCS1蛋白功能域擬合肽段體外處理人原代T細(xì)胞后,可顯著降低T細(xì)胞增殖能力,并抑制STAT3的磷酸化水平,這一結(jié)果提示,SOCS1由STAT3激活后會(huì)負(fù)反饋性抑制STAT3的活化。此外,研究人員還通過小規(guī)模臨床隊(duì)列發(fā)現(xiàn),發(fā)生GVHD的患者與移植后同期未發(fā)生GVHD的患者相比,T細(xì)胞中SOCS1的表達(dá)水平顯著降低。
綜上,研究人員通過多組學(xué)分析并結(jié)合體內(nèi)及體外功能實(shí)驗(yàn),完善了G-CSF誘導(dǎo)T細(xì)胞免疫耐受的分子機(jī)制模型:G-CSF通過與T細(xì)胞表面受體CSF3R結(jié)合,激活STAT3?;罨腟TAT3進(jìn)入細(xì)胞核,通過重塑SOCS1基因編碼區(qū)染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu),上調(diào)SOCS1的表達(dá)水平。高水平SOCS1不僅可以負(fù)反饋抑制CSF3R/STAT3通路,同時(shí)還可抑制NLRP3炎癥小體信號(hào)通路,從而抑制T細(xì)胞增殖及炎癥因子分泌,誘導(dǎo)T細(xì)胞進(jìn)入免疫耐受態(tài),降低GVHD損傷(圖3)。此研究揭示了SOCS1在抑制T細(xì)胞活化及降低GVHD中的重要調(diào)控作用,為臨床進(jìn)一步干預(yù)及預(yù)防GVHD提供了新的潛在靶點(diǎn)。
圖3. G-CSF誘導(dǎo)T細(xì)胞免疫耐受分子調(diào)控機(jī)制模式圖
北京大學(xué)人民醫(yī)院助理研究員郭惠東,北大-清華生命科學(xué)聯(lián)合中心博士生李瑞風(fēng)(現(xiàn)清華大學(xué)博士后)為本文共同第一作者。黃曉軍、李程、常英軍為本文的共同通訊作者。
來源:北京大學(xué)

