目前，超強(qiáng)新冠病毒變異株Omicron（B.1.1.529）在全球快速蔓延，為疫情防控監(jiān)測(cè)系統(tǒng)帶來(lái)了巨大挑戰(zhàn)。華大智造ATOPlex V3.0試劑盒能夠穩(wěn)定地制備覆蓋毒株全長(zhǎng)序列的測(cè)序文庫(kù)，搭配DNB測(cè)序和分析系統(tǒng)即可分型所有流行毒株。從Alpha到Omicron，只需一套建庫(kù)試劑，就可針對(duì)新型毒株提供簡(jiǎn)單有效的監(jiān)測(cè)。
讓Omicron變異株無(wú)處潛逃！一次擴(kuò)增，雙重覆蓋！華大智造ATOPlex V3.0 + DNBSEQ測(cè)序平臺(tái)聯(lián)合出擊-肽度TIMEDOO
南非一個(gè)傳染病救治點(diǎn)的醫(yī)護(hù)人員正因新冠病毒變異株的傳播忙碌
（來(lái)源/Alet Pretorius/Gallo Images/Getty）

超強(qiáng)毒株來(lái)襲 挑戰(zhàn)疫情監(jiān)測(cè)系統(tǒng)

截止日前，新冠疫情造成超過(guò)2.6億人感染，超500萬(wàn)人死亡。WHO發(fā)布的數(shù)據(jù)顯示，世界疫情已經(jīng)經(jīng)歷了三波高峰。11月11日，就在全球普遍認(rèn)為第三波疫情持續(xù)放緩之時(shí)，最新變異毒株B.1.1.529超越正在流行的優(yōu)勢(shì)株Delta毒株，成為了最新的強(qiáng)勢(shì)毒株，該毒株被WHO命名為Omicron。根據(jù)Nextclade最新的數(shù)據(jù)，Omicron變異株包含61個(gè)氨基酸突變，對(duì)應(yīng)到核酸序列上有50個(gè)新型變異，包括6個(gè)缺失突變和44個(gè)堿基替換突變（https://covariants.org/variants/21K.Omicron）。其中，刺突蛋白上有30多個(gè)突變，包括關(guān)鍵部位ACE2受體RBD區(qū)域的10個(gè)突變，很可能影響到現(xiàn)有疫苗的療效。
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Omicron變異株的突變分布圖
（來(lái)源/斯坦福大學(xué)冠狀病毒抗病毒與耐藥數(shù)據(jù)庫(kù)）
目前，基于多重PCR的測(cè)序技術(shù)是新冠毒株監(jiān)測(cè)的主流技術(shù)，從Alpha到Beta，到Delta，再到最新的Omicron，新冠病毒不斷變異，每次變異都給以PCR技術(shù)為基礎(chǔ)的測(cè)序監(jiān)測(cè)技術(shù)帶來(lái)了巨大的挑戰(zhàn)。

ATOPlex V3.0實(shí)現(xiàn)雙重覆蓋全長(zhǎng)基因組，從容應(yīng)對(duì)毒株變異

基于多重PCR核心技術(shù)，華大智造ATOPlex平臺(tái)推出V3.0版建庫(kù)試劑盒應(yīng)對(duì)疫情挑戰(zhàn)。ATOPlex V3.0試劑盒采用雙保險(xiǎn)引物設(shè)計(jì)，在一次實(shí)驗(yàn)中同時(shí)對(duì)病毒基因組進(jìn)行2次擴(kuò)增，任意一管都可以擴(kuò)增出接近新冠全長(zhǎng)序列，有效降低由于病毒突變帶來(lái)的失敗風(fēng)險(xiǎn)。
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ATOPlex V3.0工作原理
如上圖所示，Pool1和Pool2兩套不同引物池分別擴(kuò)增一個(gè)完整的新冠全基因組，從而有效降低由于毒株突變帶來(lái)的引物擴(kuò)增失敗的風(fēng)險(xiǎn)，為持續(xù)有效地檢測(cè)新型未知突變株提供有力保障。
華大智造在第一時(shí)間拿到Omicron序列后就完成了對(duì)ATOPlex試劑盒的溯源性能評(píng)估，ATOPlex V3.0建庫(kù)試劑盒聯(lián)合DNBSEQ測(cè)序系統(tǒng)能夠有效對(duì)Omicron毒株進(jìn)行分析，基因組覆蓋度超過(guò)99.2%，在鑒定新型突變的同時(shí)獲取完整基因組序列。
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ATOPlex?V3.0設(shè)備屬性
華大智造從疫情初期開(kāi)始，就一直致力于為疫情監(jiān)測(cè)系統(tǒng)提供最新、最優(yōu)的工具，并幫助多個(gè)城市和地區(qū)在第一時(shí)間確認(rèn)新冠變異毒株的分型，如Alpha、Delta等。11月29日，華大智造幫助瑞典公共衛(wèi)生局合作的卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院國(guó)家疫情中心完成首例Omicron的監(jiān)測(cè)。

ATOPlex V3.0聯(lián)合DNBSEQ測(cè)序和分析系統(tǒng)，快速應(yīng)對(duì)疫情監(jiān)測(cè)

ATOPlex V3.0聯(lián)合DNBSEQ測(cè)序系統(tǒng)，在18小時(shí)內(nèi)就能完成毒株全基因組組裝和分型工作，幫助公共衛(wèi)生監(jiān)測(cè)系統(tǒng)快速、持續(xù)地對(duì)新冠變異情況進(jìn)行跟蹤。
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華大智造抗疫產(chǎn)品
華大智造密切關(guān)注新冠突變情況，自疫情暴發(fā)初期開(kāi)始，就通過(guò)核心產(chǎn)品基因測(cè)序儀和自動(dòng)化設(shè)備為全球70余個(gè)國(guó)家疫情防控提供工具支撐。隨著疫情的不斷變化，華大智造將持續(xù)更新和優(yōu)化包括建庫(kù)測(cè)序系統(tǒng)在內(nèi)的產(chǎn)品及平臺(tái)，為新型突變和疫情監(jiān)測(cè)提供更有力的工具保障，助力全球抗疫！