最近，科學家開發(fā)了一種快速，簡單的樣品制備方法，可以增強DNA的成像效果，從而更好地分析其物理性質(zhì)和相互作用。

根據(jù)在《ACS Nano》雜志中發(fā)表的這項研究，作者將DNA與云母（一種扁平硅酸鹽礦物）結(jié)合。這個過程擴展了DNA。因此與以前的方法相比，可以分析的分子數(shù)量達到了8倍。

（圖片來源：Heenan/JILA）

液體中擴展結(jié)構的原子力顯微鏡（AFM）成像改善了DNA的生物物理數(shù)據(jù)的質(zhì)量和數(shù)量及其與蛋白質(zhì)的相互作用。該方法在很寬的鹽濃度范圍內(nèi)產(chǎn)生高質(zhì)量的圖像。高分辨率圖像顯示DNA的標志性雙螺旋結(jié)構，看起來像一個扭曲的梯子。

“我們希望這種新的樣品制備方法能夠為調(diào)節(jié)DNA與表面的結(jié)合強度鋪平道路，這有助于研究蛋白質(zhì)-DNA復合物的動力學，”作者說道。

DNA的AFM成像先前已經(jīng)在空氣和液體中進行了研究，但是對于液相中DNA的制備，此前沒有廣泛接受的方法。云母是一種十分有潛力的基質(zhì)，它表面平坦。雖然帶有負電荷，會排斥DNA，但是經(jīng)過處理之后這一問題也能夠得到解決。

在該研究中，作者首先將云母浸泡在鎳鹽溶液中，溫和漂洗和干燥，以及在含有氯化鎂和氯化鉀的溶液中將DNA與云母結(jié)合。這些鹽條件保留了與DNA結(jié)合的蛋白質(zhì)的特性。在蛋白質(zhì)-DNA復合物與云母結(jié)合后，成像前的最后一步包括用含有氯化鎳的溶液沖洗云母，該溶液通過增加DNA-云母相互作用強度來捕獲DNA結(jié)構。

這種方法首次在液體中產(chǎn)生了與平坦表面結(jié)合的DNA的AFM圖像，而不會改變其眾所周知的機械性能，包括其寬度，長度和天然骨架剛度。科學家使用這種新方法制作高質(zhì)量的DNA圖像和兩種蛋白質(zhì)-DNA復合物。 DNA蛋白復合物的增強圖像將幫助研究人員了解DNA修復和細胞代謝等過程的新細節(jié)。

來源：生物谷

資訊出處：Five-minute sample processing enhances DNA imaging and analysis

原始出處：Patrick R. Heenan, Thomas T. Perkins. Imaging DNA Equilibrated onto Mica in Liquid Using Biochemically Relevant Deposition Conditions. ACS Nano, 2019; DOI: 10.1021/acsnano.8b09234