2024.5.29-31·關聯、定位：基因組關聯分析技術應用培訓班

1年前發(fā)布在 培訓班

2024.5.29-31·關聯、定位：基因組關聯分析技術應用培訓班-肽度TIMEDOO

隨著測序技術的發(fā)展，產生了海量的基因型數據，然而如何將基因型與表型進行關聯，從而定位復雜疾病風險基因或農業(yè)動植物重要經濟性狀相關的遺傳變異卻是一項巨大挑戰(zhàn)。在過去的十年間，借助全基因組關聯分析（GWAS），科研人員發(fā)掘了大量與人類復雜疾病和農業(yè)動植物重要經濟性狀相關的遺傳變異。

我中心智能計算事業(yè)部，在基因組關聯分析領域具有豐富經驗，發(fā)表多篇領域頂級雜志。針對具備一定統(tǒng)計學、遺傳學、分子生物學基礎的生物醫(yī)學領域研究人員，特開設基因組關聯分析培訓班。

培訓特色：

無需任何計算機語言基礎；

深入淺出，內容精要實用；

結合人類醫(yī)學、動植物育種等生物學數據背景知識與實例講授；

統(tǒng)計學原理+模型/算法+編程實現+生物醫(yī)學應用；

授課老師經驗豐富，邊學邊練，重實踐，力求實效；

小班授課，個別輔導。

主辦單位：北京市計算中心有限公司

協辦單位：

北京市基因測序與功能分析工程技術研究中心

云計算關鍵技術與應用北京市重點實驗室

工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓基地

北京市大數據教學實踐基地

舉?辦?地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產業(yè)3號樓；亦可聽取線上直播

課程安排：2024年5月29-31日（周三-周五）?上9:30-11:30 下13:30-17:00

日期	主題	內容	備注
第一天	基因組關聯分析理論基礎	1、基因組學與生物信息學概述 2、基于群體遺傳的數據獲取 3、基因組關聯分析的原理、數模、策略及常用軟件介紹 4、常用GWAS數據庫介紹	理論+ 操作（上機）
	GWAS計算機基礎	1、Linux基礎for GWAS 2、R基礎for GWAS
	Plink軟件基礎應用	1、Plink軟件應用 2、Plink文件格式生成與解析 3、等位基因頻率計算 4、哈-溫平衡計算 5、基因組關聯分析流程 6、關聯分析結果分析與p校正
第二天	基因型填充Imputation	1、基因型填充Imputation的原理及應用 2、基因型填充軟件介紹與應用 3、基因組填充的方法與分析流程 4、1000G數據應用	理論+ 操作（上機）
第二天	關聯分析應用	1、基于家系的關聯分析 2、曼哈頓圖的繪制與結果展示 3、實戰(zhàn)for Plink	理論+ 操作（上機）
第三天	關聯分析應用	1、單倍型介紹 2、單倍型分析 3、LD連鎖不平衡指數計算 4、實戰(zhàn) 5、Tassel軟件介紹	理論+ 操作（上機）