利用數(shù)據(jù)湖和自然語言生成的新方法自動篩選最佳生物藥物細(xì)胞系
眾所周知,選取適當(dāng)?shù)募?xì)胞系是生物制藥工藝開發(fā)的關(guān)鍵步驟之一。選擇不當(dāng)可能會延誤規(guī)模擴(kuò)大,并損害藥物的商業(yè)潛力。根據(jù)一項研究的作者所言,成功的關(guān)鍵在于全面的特性表征,他們概述了一種利用數(shù)據(jù)湖、自然語言生成和先進(jìn)分析技術(shù)的新型選擇方法,以自動識別最佳細(xì)胞。
這個由倫敦大學(xué)學(xué)院(UCL)和阿斯利康的研究人員組成的團(tuán)隊開發(fā)了一種名為CLD4的數(shù)據(jù)驅(qū)動方法,該方法基于生產(chǎn)過程中的一系列數(shù)據(jù)來選擇克隆細(xì)胞。研究員Haneen Alosert來自UCL生化工程系,也是該研究的共同作者。她表示,這種方法不同于目前的方法,后者僅基于實驗室中可用的信息進(jìn)行選擇。
她解釋道:“目前的細(xì)胞系選擇流程考慮了每個篩選階段的數(shù)據(jù),與每個處理規(guī)模相對應(yīng)。例如,僅使用與低體積細(xì)胞生長、終點(diǎn)滴度和產(chǎn)品質(zhì)量信息相關(guān)的離線數(shù)據(jù),來選擇前列細(xì)胞系。然后,在不同規(guī)模上培養(yǎng)這些細(xì)胞系,在這些處理條件下,細(xì)胞系的表現(xiàn)受到影響,這最終影響了選擇主導(dǎo)細(xì)胞系的決策?!?/p>
“本文中討論的新方法考慮了與處理條件、生長特性、生產(chǎn)能力和產(chǎn)品質(zhì)量特征有關(guān)的不同標(biāo)準(zhǔn),這些標(biāo)準(zhǔn)使用制造可行性指數(shù)來進(jìn)行分析。該指數(shù)采用加權(quán)求和方法,總結(jié)了細(xì)胞系在每個標(biāo)準(zhǔn)內(nèi)的排名以及每個標(biāo)準(zhǔn)的相對重要性。因此,它使用一個基本度量簡化了選擇主導(dǎo)細(xì)胞系的決策?!?/p>
該方法的核心是Alosert及其同事開發(fā)的“制造可行性”指數(shù)。該指數(shù)使用多個過程參數(shù)的數(shù)據(jù)構(gòu)建,例如生長特性、處理條件、生產(chǎn)能力和質(zhì)量信息,這些數(shù)據(jù)記錄在不同規(guī)模下。
該指數(shù)用于評估候選細(xì)胞系,并為每個細(xì)胞系分配一個制造可行性指數(shù)(MI指標(biāo)),可以用來對可能在商業(yè)規(guī)模培養(yǎng)中最具生產(chǎn)力的細(xì)胞系進(jìn)行排名,根據(jù)Alosert的說法。
她繼續(xù)說道:“這使用戶可以使用MI指標(biāo)生成結(jié)果。一旦計算出MI,就會使用基于規(guī)則的自然語言生成(NLG)算法,使用與CLD決策過程中未使用的MI記錄和元數(shù)據(jù),這些與治療產(chǎn)品的商業(yè)潛力相關(guān)。
“在這種情況下提取的元數(shù)據(jù)將是針對每家公司特定的,例如影響公司組合管理和預(yù)算規(guī)劃程序的制造能力,這些被發(fā)現(xiàn)是至關(guān)重要的?!?/p>
編輯:王洪
排版:李麗


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