2021年3月4日,清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院丁強(qiáng)課題組聯(lián)合復(fù)旦大學(xué)張榮和袁正宏團(tuán)隊(duì)在《PNAS》(美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊)發(fā)表題為《新冠病毒受體ACE2同源基因的功能和遺傳分析揭示其廣泛的潛在宿主范圍》(Functional and Genetic Analysis of Viral Receptor ACE2 Orthologs Reveals a Broad Potential Host Range of SARS-CoV-2)的研究論文。該研究發(fā)現(xiàn)44個(gè)物種,包括家畜、寵物以及動(dòng)物園中的動(dòng)物的細(xì)胞表面受體血管緊張素轉(zhuǎn)化酶II(ACE2)可以與新冠病毒的刺突蛋白(Spike,S)結(jié)合從而介導(dǎo)SARS-CoV-2進(jìn)入靶細(xì)胞。該研究為新冠病毒潛在的宿主范圍和跨物種傳播提供了細(xì)胞水平上的實(shí)驗(yàn)證據(jù),表明新冠病毒可能具有廣泛的宿主范圍,提示了監(jiān)測(cè)潛在宿主對(duì)于控制疫情反復(fù)的重要性。
清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院丁強(qiáng)課題組聯(lián)合復(fù)旦大學(xué)張榮和袁正宏團(tuán)隊(duì)揭示了新冠病毒廣泛的潛在宿主范圍-肽度TIMEDOO
圖1.尋找SARS-CoV-2的中間宿主
圖源:https://www.nature.com/articles/d41586-021-00531-z

作者:David Parkins

新冠疫情已對(duì)全球公共衛(wèi)生安全和經(jīng)濟(jì)發(fā)展造成了重大威脅,但其潛在的宿主目前仍不清楚。對(duì)疫情防控來(lái)說(shuō),找到新冠病毒的中間宿主極為重要,只有確定中間宿主才能切斷“動(dòng)物傳人”的源頭,防止病毒再次傳播。目前通過(guò)基因組分析認(rèn)為SARS-CoV-2的源頭很可能是蝙蝠,但蝙蝠直接將病毒傳染給人類的概率很小,所以可能有其他哺乳動(dòng)物物種充當(dāng)了中間宿主的角色,病毒在中間宿主體內(nèi)進(jìn)化后最終獲得了感染人的能力。

為了明確新冠病毒的宿主范圍,研究人員首先根據(jù)SARS-CoV-2的S蛋白與ACE2的結(jié)構(gòu)信息,確定了5個(gè)位于結(jié)合界面上高度保守的關(guān)鍵氨基酸。以這5個(gè)氨基酸作為篩選標(biāo)準(zhǔn),從將近300個(gè)ACE2同源序列中篩選出了80個(gè)同源序列,并發(fā)現(xiàn)這些可能與新冠S蛋白結(jié)合的ACE2序列均來(lái)自于哺乳動(dòng)物。接下來(lái),研究者選擇了48個(gè)有代表性的ACE2同源序列在無(wú)內(nèi)源ACE2表達(dá)的人非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞(A549)中表達(dá),包括家畜、寵物,動(dòng)物園和水族館中的動(dòng)物等與人類接觸密切的物種。首先通過(guò)結(jié)合實(shí)驗(yàn)評(píng)估不同物種ACE2結(jié)合S蛋白的能力,即將SARS-CoV-2的S1蛋白與過(guò)表達(dá)不同物種ACE2的A549細(xì)胞共孵育。結(jié)果發(fā)現(xiàn)除了三種新世界猴(白色簇絨耳狨猴、松鼠猴和簇毛捲尾猴)、考拉、鼬科動(dòng)物(雪貂,水貂)的ACE2檢測(cè)不到與S1蛋白的結(jié)合之外,其余物種的ACE2與S1蛋白均有較強(qiáng)的結(jié)合。接下來(lái),為了直接評(píng)估不同ACE2介導(dǎo)病毒進(jìn)入細(xì)胞的功能,研究者用 SARS-CoV-2活病毒感染過(guò)表達(dá)ACE2的A549細(xì)胞,結(jié)果與上述結(jié)合實(shí)驗(yàn)的結(jié)果一致,表達(dá)三種新世界猴子和考拉ACE2的細(xì)胞不能被病毒感染,過(guò)表達(dá)水貂和雪貂ACE2的細(xì)胞僅檢測(cè)到較少的病毒感染信號(hào),其它物種ACE2過(guò)表達(dá)細(xì)胞中均檢測(cè)到了大量病毒感染信號(hào)(圖2)。該結(jié)果表明多個(gè)物種ACE2可能都具有介導(dǎo)新冠病毒進(jìn)入的潛力,因此SARS-CoV-2可能具有廣泛的宿主范圍。

此外,對(duì)于三種新世界猴ACE2不能介導(dǎo)新冠病毒進(jìn)入的現(xiàn)象,研究者分析了ACE2與S蛋白結(jié)合界面上的氨基酸序列。發(fā)現(xiàn)在新世界猴ACE2序列中這些位點(diǎn)保守性較低,并且新世界猴ACE2的H41和E42與其他物種ACE2高度保守的Y41和Q42不一致。研究者通過(guò)結(jié)合實(shí)驗(yàn)和病毒感染實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證明了這兩個(gè)位點(diǎn)的重要性,將這兩個(gè)氨基酸突變?yōu)閅和Q后,使新世界猴的ACE2獲得了支持新冠病毒進(jìn)入細(xì)胞的能力。

清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院丁強(qiáng)課題組聯(lián)合復(fù)旦大學(xué)張榮和袁正宏團(tuán)隊(duì)揭示了新冠病毒廣泛的潛在宿主范圍-肽度TIMEDOO
圖2.對(duì)不同物種ACE2介導(dǎo)SARS-CoV-2真病毒入侵的功能評(píng)估
清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院劉迎輝博士,復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院胡高維,王玉燕,清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院博士生任文琳,研究助理趙小敏為并列第一作者。清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院丁強(qiáng)研究員,復(fù)旦大學(xué)張榮研究員和袁正宏教授為共同通訊作者。該研究由國(guó)家自然科學(xué)基金、北京市自然科學(xué)基金、清華大學(xué)自主科研計(jì)劃、清華-北大生命科學(xué)聯(lián)合中心以及清華大學(xué)結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖中心等資助完成。

原文鏈接:

https://www.pnas.org/content/118/12/e2025373118

來(lái)源:清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院