2020年11月10日，深圳市第三人民醫(yī)院聯(lián)合深圳華大生命科學(xué)研究院在國際知名學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞發(fā)現(xiàn)》（Cell Discovery）發(fā)表了題為“Initial whole-genome sequencing and analysis of the host genetic contribution to COVID-19 severity and susceptibility”的研究成果，發(fā)現(xiàn)新冠癥狀嚴(yán)重程度與患者自身遺傳因素有關(guān)，為認(rèn)識新冠的作用機(jī)制、科學(xué)防控新冠肺炎疫情提供了參考。

Cell Discovery?網(wǎng)站截圖

由SARS-CoV-2病毒引起的新型冠狀病毒肺炎（COVID-19）在全球范圍內(nèi)大流行，截止到2020年11月9日，全球已有逾5010萬感染病例，125萬死亡病例。根據(jù)報道，不同個體在感染新冠病毒(SARS-CoV-2)后的癥狀有較大差異，約80-85%的感染者表現(xiàn)為無癥狀或者輕癥，15-20%的患者則罹患重癥、危重癥甚至死亡。除年齡、性別、并發(fā)癥等已知的高風(fēng)險因素外，患者自身的遺傳背景也是影響其癥狀嚴(yán)重程度的重要因素。

自疫情發(fā)生以來，已有多項新冠患者遺傳背景與免疫反應(yīng)、嚴(yán)重程度以及易感性等相關(guān)研究在不同國家開展。其中，英國最近的雙胞胎研究顯示新冠患者的臨床表現(xiàn)和易感性受到遺傳因素較強(qiáng)的影響^[1]；西班牙和意大利的研究則在三號及九號染色體上發(fā)現(xiàn)了與重癥顯著關(guān)聯(lián)的基因座^[2]，其中三號染色體上的相關(guān)區(qū)域可能與已經(jīng)滅絕的尼安德特人有關(guān)^[3]；基于中國人群的臨床數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析曾顯示新冠患者和正常人群的ABO血型比例存在差異^[4]，間接提示遺傳因素對癥狀的影響。

本項目聯(lián)合研究團(tuán)隊基于華大智造自主可控的基因測序技術(shù)（DNBSEQ^TM技術(shù)）首次探究了中國人群遺傳背景對新冠癥狀嚴(yán)重程度以及易感性的影響。課題組招募了332例核酸陽性但表現(xiàn)為無癥狀，輕癥，普通，重癥和危重等不同嚴(yán)重程度的新冠患者。通過對患者及自然對照人群進(jìn)行深度測序和分析，發(fā)現(xiàn)了位于六號染色體的人類白細(xì)胞抗原區(qū)域（HLA）特定單倍型以及GOLGA3、 DPP7等基因功能的缺失會增加罹患新冠重癥的風(fēng)險。

此外，雖然流行病學(xué)研究顯示我國與歐洲人群新冠患者有著相似的癥狀分布比例，但曾在歐洲人群中發(fā)現(xiàn)與重癥顯著關(guān)聯(lián)的三號染色體相關(guān)基因多態(tài)性位點(diǎn)rs11385942在此項研究的患者人群中頻率為0，在ChinaMAP^?[5]等其它中國人群數(shù)據(jù)庫中的頻率也極低，關(guān)聯(lián)信號無法得到重復(fù)，提示不同遺傳背景的人群感染后癥狀嚴(yán)重程度可能不同，需要進(jìn)一步深入研究與比較。

該研究成果的發(fā)布將有力推動新冠相關(guān)的基礎(chǔ)科學(xué)研究，所發(fā)現(xiàn)的遺傳背景差異將為科研人員進(jìn)一步認(rèn)識新冠病毒及其與人體的相互作用機(jī)制提供指引，進(jìn)而為科學(xué)防控新冠肺炎疫情提供參考。

深圳市第三人民醫(yī)院的劉磊教授、何清教授以及深圳華大生命科學(xué)研究院的金鑫研究員、劉斯洋研究員為論文共同通訊作者。深圳三院王方教授等為共同第一作者。項目得到了深圳國家基因庫的平臺支持。

*本項目按照我國人類遺傳資源管理相關(guān)規(guī)定開展，相關(guān)數(shù)據(jù)已在科技部備案并獲得批準(zhǔn)。