基因融合驅(qū)動(dòng)多種癌癥:研究揭示潛在治療新靶點(diǎn)-肽度TIMEDOO

美國德克薩斯大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心(UT Southwestern Medical Center)的一項(xiàng)最新研究發(fā)現(xiàn),一種基因突變可導(dǎo)致兩個(gè)基因融合,從而驅(qū)動(dòng)包括侵襲性腎癌在內(nèi)的多種癌癥的發(fā)生。研究顯示,這些融合蛋白通過形成蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),改變細(xì)胞內(nèi)的基因表達(dá)機(jī)制,進(jìn)而誘發(fā)腫瘤。相關(guān)成果近日發(fā)表在《Cell》雜志上,有望為治療侵襲性腎癌以及其他癌種帶來新思路。

“我們的研究揭示了不同癌癥中致病性融合基因(oncofusions)所共享的一種共同分子機(jī)制,也為開發(fā)潛在的治療靶點(diǎn)提供了方向。”本研究的共同通訊作者、本中心西蒙斯綜合癌癥中心成員Benjamin Sabari博士表示。

此次研究的第一作者為Lyons博士(現(xiàn)為斯坦福大學(xué)博士后研究員)和Prashant Pradhan博士(德州西南醫(yī)學(xué)中心博士后研究員),兩人曾在Sabari博士課題組共事。

染色體易位導(dǎo)致的基因融合(oncofusion)在多種癌癥中并不罕見,約有17%的惡性腫瘤與此有關(guān)。但這些融合蛋白為何具有致癌能力,目前尚未完全厘清。研究團(tuán)隊(duì)聚焦于“易位型腎細(xì)胞癌”(translocation renal cell carcinoma,簡稱tRCC)——這是一種高度侵襲性腎癌,占成人腎癌的4%左右,是兒童最常見的腎癌類型。

在約三分之二的tRCC病例中,致癌因素是TFE3轉(zhuǎn)錄因子基因與PRCC、ASPL或SFPQ三者之一的融合。這些基因在功能上看似并無共通之處,因此TFE3為何傾向于與它們?nèi)诤?,以及這種融合如何導(dǎo)致癌變,一直是未解之謎。

為了破解這個(gè)謎題,研究團(tuán)隊(duì)利用來自德州西南醫(yī)學(xué)中心腎癌項(xiàng)目的患者樣本進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)TFE3融合蛋白在細(xì)胞內(nèi)能形成“生物分子凝聚體”(biomolecular condensates),而正常的TFE3蛋白則不會(huì)。這表明,盡管融合基因的伴侶不同,但它們都具備促成凝聚體形成的潛能。

此前Sabari團(tuán)隊(duì)的研究表明,凝聚體可以通過選擇性地招募轉(zhuǎn)錄調(diào)控蛋白,來調(diào)控特定基因的表達(dá)。此次他們進(jìn)一步驗(yàn)證,TFE3融合蛋白所形成的凝聚體確實(shí)可以富集RNA聚合酶II——這一關(guān)鍵酶負(fù)責(zé)將DNA轉(zhuǎn)錄為RNA,是蛋白質(zhì)合成的第一步。

研究人員進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),TFE3融合蛋白之所以能與RNA聚合酶II結(jié)合,是因?yàn)槠浒被嵝蛄兄懈缓膳c該酶發(fā)生化學(xué)作用的特定殘基。通過對(duì)比正常TFE3與融合版本的氨基酸組成,并進(jìn)行突變交換實(shí)驗(yàn),研究人員證實(shí)了這些特定氨基酸在誘導(dǎo)RNA聚合酶II結(jié)合和異?;蜣D(zhuǎn)錄中的關(guān)鍵作用。

更令人關(guān)注的是,當(dāng)研究人員人為改變正常TFE3,使其擁有融合版本中的“關(guān)鍵氨基酸”,細(xì)胞便表現(xiàn)出癌變特征——包括增殖加快、侵襲性增強(qiáng)和遷移性提升。這也進(jìn)一步印證了融合蛋白通過調(diào)控RNA聚合酶II,引導(dǎo)癌變相關(guān)基因表達(dá)的機(jī)制。

研究團(tuán)隊(duì)還分析了多個(gè)癌癥中已知的融合基因突變,發(fā)現(xiàn)這些融合蛋白中也存在類似TFE3融合蛋白的氨基酸特征,并同樣具備富集RNA聚合酶II的能力。這一發(fā)現(xiàn)暗示,這一機(jī)制可能廣泛存在于多種癌癥中。

“如果能找到方法阻斷這些異常的蛋白質(zhì)互作,或許就能為這類融合驅(qū)動(dòng)型癌癥帶來全新的治療策略?!盨abari博士表示,他的團(tuán)隊(duì)接下來將繼續(xù)致力于開發(fā)相應(yīng)的干預(yù)方法。

參考文獻(xiàn):Heankel Lyons et al, RNA polymerase II partitioning is a shared feature of diverse oncofusion condensates,?Cell?(2025).?DOI: 10.1016/j.cell.2025.04.002

編輯:王洪

排版:李麗