歡迎各位來到“circRNA研究報道匯總”欄目，本期共收集最新發(fā)布的circRNA文獻16篇，下面我們一起來看看circRNA研究有哪些新進展。

1、綜述：circRNA生物起源、功能及研究挑戰(zhàn)

論文標題：The Biogenesis, Functions, and Challenges of Circular RNAs.

雜志：Mol Cell?影響因子：14.248

通訊作者單位：上海中科院

上海中科院楊力，陳玲玲教授在Molecular cell雜志上發(fā)表了最新circRNA研究綜述文章，主要匯總了circRNA形成機制、功能和目前研究挑戰(zhàn)等方面內(nèi)容。CircRNA往往同宿主基因（host gene）來源于同一轉錄產(chǎn)物，相當一部分文章報道了circRNA與host gene間的相關性，但具體機制還需更多研究。CircRNA與宿主mRNA序列高度一致，僅接頭位置序列不同，這給circRNA的檢測技術帶來了相當?shù)碾y度。如跨接頭設計PCR引物，定量鑒定circRNA分子；siRNA和ASO（反義核苷酸）對circRNA進行敲低，circRNA過表達載體構建，病毒包裝；FISH探針檢測circRNA亞細胞定位等，circRNA的這些研究技術都有提升的空間，該綜述的具體解讀見本官網(wǎng)文章：楊力陳玲玲教授Molecular Cell雜志發(fā)表長篇circRNA綜述。

2、circFBLIM1競爭性吸附miR-346來促進肝細胞癌的發(fā)展

論文標題：circFBLIM1 act as a ceRNA to promote hepatocellular cancer progression by sponging miR-346.

雜志：J Exp Clin Cancer Res?影響因子：6.217

通訊作者單位：中南大學湘雅醫(yī)院

肝癌是一種常見的惡性疾病。據(jù)估計，2012年全世界有778500個新病例和745 500例肝癌死亡病例。大部分原發(fā)性肝癌是肝細胞癌（HCC），往往在晚期才能被診斷出來，治療手段是手術切除或肝移植，盡管手術不斷改善，但預后任然很差。因此深入理解肝癌發(fā)病機制，獲得新肝癌治療靶標一直是科學家探索的方向，circRNA在眾多生理功能和疾病發(fā)生發(fā)展過程起著重要作用。本文從circRNA角度出發(fā)，挖掘circRNA在肝癌中的作用機制。研究者通過circRNA微陣列芯片篩選肝癌組織中的差異表達circRNA，并經(jīng)過qRT-PCR驗證發(fā)現(xiàn)circFBLIM1在肝癌中異常高表達，進一步細胞功能研究表明circFBLIM1可促進肝癌細胞增殖和侵襲，抑制凋亡。敲低circFBLIM1則細胞表現(xiàn)出抑癌表征，說明circFBLIM1在肝癌中可能起癌基因角色。進一步分子機制研究，luciferase報告基因實驗表明circFBLIM1可競爭性結合miR-346，而miR-346下游的靶基因正是circFBLIM1的宿主基因FBLIM1，因此研究結果表明circFBLIM1通過競爭性吸附miR-346，上調(diào)其自身宿主基因FBLIM1的表達，進而促進肝癌的發(fā)展，由此circFBLIM1可作為肝癌診斷治療的潛在靶標。

圖注：circFBLIM1通過ceRNA 機制（miR-346）調(diào)控FBLIM1

A:qPCR和WB檢測FBLIM1在HCC細胞中的表達水平；

B：qPCR檢測circFBLIM1在50例HCC組織和癌旁組織的表達情況，顯著高表達；

C：生物信息預測miR-346結合FBLIM1的?3’UTR；

D：luciferase報告基因分析顯示miR-346可直接結合調(diào)控FBLIM1；

E：HCC細胞中轉染miR-346后，qPCR檢測FBLIM1的表達；

F：siRNA干擾FBLIM1后，qPCR檢測miR-346表達水平（上調(diào)）；

G&H： HCC細胞轉染NC, si-circFBLIM1 或si-circFBLIM1 +miR-346 LNA后，qCPR檢測FBLIM1或circFBLIM1的表達；

i： HCC細胞轉染miR-NC, miR-346 或miR-346+si-circFBLIM1后，CCK8檢測細胞增殖能力；

J：HCC細胞轉染miR-NC, miR-346 或miR-346+si-circFBLIM1后，細胞凋亡情況檢測。

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3、CircRNA8924通過競爭性結合MiR-518d-5p/519-5p家族調(diào)節(jié)CBX8的表達進而促進子宮頸癌細胞增殖、遷移和侵襲

論文標題：CircRNA8924 Promotes Cervical Cancer Cell Proliferation, Migration and Invasion by Competitively Binding to MiR-518d-5p /519-5p Family and Modulating the ex pression of CBX8

雜志：cell Physiol Biochem.?影響因子：5.5

通訊作者單位：遼寧省腫瘤醫(yī)院

宮頸癌（Cervical cancer，CC）是世界上最常見的婦科癌癥，并且已經(jīng)證明持續(xù)感染高危型人乳頭瘤病毒（HR-HPV）是其宮頸癌組織發(fā)生和發(fā)展的重要致病因素。 隨著近年來HPV疫苗的廣泛應用，宮頸癌的一級預防已在一定程度上得到實現(xiàn)，其發(fā)病率和死亡率在許多發(fā)達國家得到有效控制。 然而，較高的HPV感染率始終伴隨著相對較低的CC發(fā)病率，這不僅使CC篩查和一級預防成為衛(wèi)生經(jīng)濟學的沉重經(jīng)濟負擔，而且暗示CC中的個體遺傳差異和其他重要因素。因此，必須探索CC的確切發(fā)病機制，并找到全新的診斷標志物作為潛在的治療靶點。近年來，circRNA成為疾病研究的熱點， 與具有傳統(tǒng)線性結構的miRNA和lncRNA不同，circRNA是共價閉合的連續(xù)環(huán)。由于缺乏3’，5’末端和poly A尾，circRNAs可以避免外切核酸酶和RNase R的降解作用。與線性RNA相比，circRNA更保守和穩(wěn)定，并顯示細胞特異性，組織特異性和階段性。

在該研究中，研究者使用人circRNA微陣列篩選CC組織和配對的癌旁正常組織，結果顯示circRNA8924是顯著上調(diào)。 CircRNA8924（DeepBase）也稱為hsa_circ_0141539（circBase），來源于Clorf116基因的外顯子，位于chr1：2072008388-207201024。通過生物信息學分析，發(fā)現(xiàn)miR-519a-5p，miR-519c-5p和miR-518e-5p與circRNA8924的具有較強的結合位點。這些miRNA屬于miR-518d-5p / 519-5p家族，并且大多數(shù)家族成員具有相同的核苷酸序列，僅有1或2個核苷酸差別。miR-518d-5p / 519-5p家族其中一些成員已在腫瘤中報道。最近的研究表明，miR-526a在肝癌組織中的低表達可以靶向PAK7的調(diào)節(jié)。 miR-526a的過表達顯著抑制HCC細胞Huh7和HepG2的增殖，遷移，侵襲和異位種植。然而，miR-518d-5p / 519-5p家族在CC中的表達和機制尚不清楚。該研究首次證明了circRNA8924在CC的腫瘤發(fā)生中的重要作用，并揭示其作為ceRNA的功能，通過海綿miR-518-d-5p / 519-5p調(diào)節(jié)CBX8的表達。

圖注：宮頸癌中circRNA8924與miR-519a-5P表達相關性研究

A：qPCR檢測miR-519a-5p在宮頸癌組織標本（n=33）中顯著低表達；

B：circRNA8924與miR-519a-5P在宮頸癌組織中的表達水平顯著負相關；

C：circRNA8924與miR-519a-5P結合位點預測及突變位點示意圖；

D：luciferase報告基因證明circRNA8924與miR-519a-5P可直接結合；

E：shRNA敲低circRNA8924后，qPCR檢測miR-519a-5p的表達水平升高；

4、circ2Disease：人工編輯的經(jīng)過實驗驗證的人類疾病circRNAs的數(shù)據(jù)庫?

論文標題：Circ2Disease: a manually curated database of experimentally validated circRNAs in human disease

雜志：Sci Rep.??影響因子：4.122

通訊作者單位：浙江大學醫(yī)學院

環(huán)狀RNA（circRNAs）是一類新的RNA分子，在人類疾病中發(fā)揮著重要作用。越來越多的circRNA被證明具有生物學功能，所以很有必要整合相關信息以促進人類疾病中circRNA功能和分子調(diào)控網(wǎng)絡的研究。Circ2Disease數(shù)據(jù)庫包含233個circRNA和54個人類疾病，以及273條人工整理的疾病-circRNA關聯(lián)記錄，120個circRNA-疾病關聯(lián)具有較強的實驗證據(jù)。每個關聯(lián)包括circRNA名稱，疾病名稱，表達模式，實驗方法，circRNA-疾病關系的簡要功能描述，以及其他詳細信息。經(jīng)過實驗驗證的miRNA可能被這些circRNA及其驗證目標“吸附”，也被整合進circRNA分子網(wǎng)絡。Circ2Disease提供用戶友好的界面，便于瀏覽，搜索，分析網(wǎng)絡和下載數(shù)據(jù)。Circ2Disease將顯著提高我們對疾病中circRNA失調(diào)的理解，并且是研究circRNA在人類疾病中的轉錄后調(diào)節(jié)作用的有用資源。

Circ2Disease數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址：http://www.disease-ontology.org/

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文獻列表：

文 | circRNA 吉賽生物

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