2023.8.18-20|微生物與微生物組課題設計與高通量測序數(shù)據(jù)分析培訓班

2年前發(fā)布在 培訓班

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微生物在人們日常生活、學習、科研中隨處可見，也同每個人息息相關，經(jīng)過多期培訓以及學員反饋，特開設更為貼合科研工作者、初學者的需求的微生物主題培訓。課程分為三部分：

第一部分以理論概念講述、課題設計、文獻分享為主，主要目的是幫助科研工作者把握領域的基本情況、了解領域熱點問題、從而可以獨立進行課題設計與實驗計劃安排，以演示為主；

第二部分以操作邏輯講解、報告解讀、文章優(yōu)化為主，主要目的是幫助科研工作者串聯(lián)基本的分析脈絡、整理文章圖表進行文章優(yōu)化，以演示和操作為主；

第三部分以實際編程操作、上機練習為主，主要目的是幫助時間較為充足的科研工作者實現(xiàn)從分析的初級結果中提煉出有效信息，整理出圖表，深入理解編程軟件的基本用法，以演示、操作和練習為主。

其中，第一部分和第二部分主要面向涉及課程設計的科研工作者，第二部分和第三部分主要面向即將進入該領域，有大量精力可以用來學習的學生。

課程目的

1. 掌握相關的基礎知識；

2. 掌握微生物學和微生物組學的基本概念；

3. 掌握擴增子測序技術、宏基因組、宏轉錄組、宏代謝組測序技術的基本概念、分析邏輯；

4. 掌握相關文章邏輯把握和呈現(xiàn)形式，以及相關的分析技能。

主講專家

邀請一直從事微生物組研究的教授、研究員等專家，有豐富的系統(tǒng)性科研訓練經(jīng)歷和授課經(jīng)驗，任職于北京各高校和研究所，有Nat. Commun.、Nucleic Acids Res.、Gut、Genome Biology等國際頂級刊物多篇文章發(fā)表。

培訓時間

2023年08月18日-08月20日，上午9:30-12:00，下午13:30-18:00

北京市海淀區(qū)豐賢中路7號3號樓

課程大綱

微生物與微生物組課題設計與高通量測序數(shù)據(jù)分析培訓班課程目錄
第一章微生物與微生物組研究理論基礎	1.1 微生物與微生物組研究背景與現(xiàn)狀 1.2 基因組學與微生物組學 1.3 微生物組研究項目設計 1.4 微生物組研究文獻綜述
第二章生物信息學在微生物組研究中的應用	2.1 生物信息學背景介紹 2.2 常用參考數(shù)據(jù)庫介紹 2.3 常用微生物基因組分析流程介紹 2.4 常用微生物組分析流程介紹 2.5 常用軟件使用介紹與練習 2.6 應用案例與課后練習
第三章微生物組擴增子測序方案及結果解讀	3.1 16S/ITS擴增子研究方案介紹 3.2 分析報告解讀 3.3 擴增子測序分析文獻詳解
第四章微生物組宏基因組測序和宏轉錄組測序方案及結果解讀	4.1 宏基因組、宏轉錄組、宏病毒組、宏代謝組研究方案介紹 4.2 分析報告解讀 4.3 宏基因組、宏轉錄組、宏病毒組、宏代謝組文獻詳解 4.4 整合型研究文獻分析詳解
第五章 R語言在微生物組研究中的應用	5.1 編程基礎簡介 5.2 R語言基礎與練習 5.3 R語言的統(tǒng)計與繪圖 5.4 R語言在微生物組研究中的應用案例 5.5制圖軟件優(yōu)化