可鑒病毒，能追“真兇”！華大智造方艙+測序?qū)嶒?yàn)室雙平臺合力助推海口抗疫

4年前發(fā)布在 7X24h 資訊

1月28日，華大智造“移動核酸檢測+基因測序”雙平臺在?？谕度胧褂?。雙平臺分兩個實(shí)驗(yàn)室運(yùn)行，分別是方艙實(shí)驗(yàn)室與測序?qū)嶒?yàn)室，這兩個實(shí)驗(yàn)室可以單獨(dú)使用，也可共同“奮戰(zhàn)”。不僅能為?？谑刑峁┐笠?guī)模核酸檢測，還幫助?？谑衅平獠《救蚪M序列，為當(dāng)?shù)卮汗?jié)疫情防控提供支持。

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新冠病毒傳播范圍越廣，發(fā)生變異的機(jī)率就越大。在保證大范圍核酸檢測的同時(shí)，破解病毒全基因組序列，監(jiān)控病毒變異顯得非常重要。1月20日，國務(wù)院聯(lián)防聯(lián)控機(jī)制印發(fā)《關(guān)于進(jìn)一步做好當(dāng)前新冠肺炎疫情防控工作的通知》，要求各地要對核酸檢測能力再摸底、再提升，同時(shí)完善病毒基因測序能力布局。

華大智造積極響應(yīng)國家號召，將方艙實(shí)驗(yàn)室與基因測序平臺結(jié)合，形成了“移動核酸檢測+基因測序”雙平臺，雙平臺分兩個實(shí)驗(yàn)室運(yùn)行，分別是方艙實(shí)驗(yàn)室與測序?qū)嶒?yàn)室。當(dāng)中方艙實(shí)驗(yàn)室可以靈活布置到車站、港口、社區(qū)等場所，滿足大通量的檢測需求。測序?qū)嶒?yàn)室可以監(jiān)控病毒變異，為后續(xù)疫情防控工作提供有效依據(jù)。

可鑒病毒，能追“真兇”！華大智造方艙+測序?qū)嶒?yàn)室雙平臺合力助推海口抗疫-肽度TIMEDOO

?？谑屑部刂行奈⑸餀z驗(yàn)科副科長李平介紹，方艙實(shí)驗(yàn)室占地34平方米，里面分為試劑準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本制備區(qū)、擴(kuò)增分析區(qū)和高壓消毒區(qū)。通過基因擴(kuò)增方法，可以完成一站式核酸檢測，大大提高檢測效率，可以有效應(yīng)對大規(guī)模人群的核酸檢測需要。

方艙實(shí)驗(yàn)室每個班次需4人至5人操作,不混樣檢每日檢測6000人次，混樣（10混1）每日檢測6萬人次。檢測高通量得益于配備了由華大智造自主研發(fā)的全自動MGISTP-7000分杯處理系統(tǒng)、自動化設(shè)備MGISP-960以及實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)MGI ZLIMS組合而成的一站式平臺?？梢詫?shí)現(xiàn)全自動化樣本條碼掃描、錄入和分裝程序，自動化提取核酸并實(shí)時(shí)監(jiān)控管理核酸檢測全過程。

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高通量，日通量：6000（不混樣），6萬（混樣：10混1）——方艙實(shí)驗(yàn)室

先進(jìn)的自動化設(shè)備和系統(tǒng)代替了人工。配備了全自動MGISTP-7000分杯處理系統(tǒng)、自動化設(shè)備MGISP-960以及實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)MGI ZLIMS。

?監(jiān)控病毒變異——測序?qū)嶒?yàn)室

綁定了華大智造自主研發(fā)的基因測序平臺，能破解病毒全基因組序列,配備了自動化樣本制備系統(tǒng)MGISP-100、高通量基因測序儀MGISEQ-200、PFI病原感染快速鑒定系統(tǒng)。

更快速——方艙實(shí)驗(yàn)室

集裝箱改造而成，方便車載運(yùn)輸，可根據(jù)疫情防控所需，靈活布置到車站、港口、社區(qū)等場所。大大減少了樣本運(yùn)送流轉(zhuǎn)的時(shí)間, 減少了患者的流動，較好的控制疫情。

安全可靠——方艙實(shí)驗(yàn)室

符合加強(qiáng)型二級生物安全實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)。整體負(fù)壓，該實(shí)驗(yàn)室設(shè)置試劑準(zhǔn)備間、樣本處理間、檢測間三個主檢測功能區(qū)。同時(shí)配套進(jìn)、出更衣室及高壓消殺設(shè)備和空調(diào)及機(jī)電室。人員單向流，各實(shí)驗(yàn)區(qū)之間采用傳遞窗及緩沖間隔離，防止氣溶膠污染。

測序?qū)嶒?yàn)室里面裝備了華大智造自主研發(fā)的基因測序平臺。該基因測序平臺可以“連線”方艙實(shí)驗(yàn)室，里面配備了華大智造自動化樣本制備系統(tǒng)MGISP-100、高通量基因測序儀MGISEQ-200、PFI病原感染快速鑒定系統(tǒng)。樣本在方艙實(shí)驗(yàn)室被確定為陽性樣本后，可以通過基因測序平臺快速、準(zhǔn)確、全面地將病毒進(jìn)行分類鑒定，同時(shí)提供完整的病毒基因序列信息。

新冠疫情爆發(fā)至今，華大智造對于破解病毒全基因組序列，監(jiān)控病毒變異的研究早已積累了豐富的經(jīng)驗(yàn)。早在2019年12月，在最早一批提交至全球共享流感病毒數(shù)據(jù)庫GISAID發(fā)布的13例新型冠狀病毒基因組序列數(shù)據(jù)中，有5例數(shù)據(jù)來自華大智造高通量測序儀，這為研究分析新型冠狀病毒的進(jìn)化來源、致病病理機(jī)制提供了第一手資料。

新冠疫情爆發(fā)，華大智造緊急部署2臺DNBSEQ-T7超高通量測序儀運(yùn)達(dá)武漢，配合MGISEQ-2000，第一時(shí)間獲得病毒的全基因組序列，為后續(xù)疫情防控、試劑盒開發(fā)、疫苗研發(fā)提供了有效依據(jù)。